Guilty Gear Strive: Dual Rulers kể về Sin Kiske, đứa con cấm kỵ giữa một con người và một vũ khí sinh học được tạo ra bằng ma thuật gọi là Gear, sống trong một thế giới nơi ma thuật đã thay thế khoa học, và những vết sẹo từ cuộc nổi loạn của Gear vẫn còn hiện hữu. Khi tham dự đám cưới phá vỡ điều cấm kỵ của cha mẹ mình, cậu gặp một cô gái bí ẩn mang lòng thù hận sâu sắc với Gear — và cuộc gặp gỡ định mệnh đó một lần nữa đe dọa sẽ đảo lộn cả thế giới.